Skanery online mają wiele zalet. Są one programami bezpłatnymi, które wymagają jedynie zapisania lekkich plików na komputerze. Nie trzeba instalować dużych plików i rejestrować się. Skanery opierają się na rozwiązaniach technologicznych oraz bazach sygnatur stworzonych przez producentów. Są one skuteczne w analizowaniu i wykrywaniu szkodliwego oprogramowania oraz usuwania go z komputera. Działają tylko na żądanie użytkownika. Skanery online, działając jedynie na żądanie, nie zapewniają pełnej ochrony podczas korzystania z komputera. Brak ciągłej ochrony może wiązać się z kłopotami dla właścicieli komputerów. Skanery online oferują wyłącznie ochronę w podstawowym zakresie. Poszukując kompleksowych i wszechstronnych rozwiązań powinniśmy się jednak zdecydować na pełne wersje tradycyjnych pakietów antywirusowych.